当寺は、もとは江戸寛永年間より宝乗院と称し、天台宗総本山　比叡山延暦寺　東塔北谷の一院でした。
しかし、明治2年に火災で御堂を焼失。幸いにも本尊不動明王、脇士二童子（県重要文化財）は前日に移動していたため、被災を免れました。
明治時代に、兵庫湊川に移転再興後、信州善光寺の御分身一光三尊善光寺如来を請来し、大正8年に宝乗山善光寺と改称。昭和15年には六甲山麓の現在地に移転しました。
平成7年には阪神・淡路大震災に被災し阿弥陀堂、客殿、茶室が全壊。
現状の講堂は平成10年に再建したものです。

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  宝乗山善光寺縁起石塔

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  本尊不動明王（伝慈覚大師御作・藤原時代）

  脇士矜羯羅、制吒迦両童子（鎌倉時代）

  重要文化財

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  内佛殿宮殿